Este conjunto de dados foi desenvolvido para investigar os efeitos de diferentes protocolos de treinamento físico sobre mecanismos moleculares e inflamatórios da retina e das glândulas lacrimais em camundongos envelhecidos, em condições fisiológicas e em modelo experimental de doença do olho seco. O objetivo foi avaliar como o exercício físico aeróbico e o exercício de força modulam a sinalização da clusterina/apolipoproteína J (APOJ) e de seu receptor, contribuindo para a manutenção da homeostase tecidual ocular durante o envelhecimento. Os dados sustentam a tese de doutorado de Thais Dantis Pereira de Campos, desenvolvida no Programa de Pós-Graduação em Nutrição, Esporte e Metabolismo (CNEM) da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), e contribuem para a compreensão dos mecanismos moleculares que integram exercício físico, envelhecimento e disfunções oculares. O conjunto inclui dados quantitativos obtidos de camundongos envelhecidos distribuídos em grupos sedentários e treinados, submetidos a protocolos de exercício aeróbico ou de força, com e sem indução da doença do olho seco. Os dados compreendem avaliações da produção lacrimal, expressão gênica relativa (qPCR) de marcadores inflamatórios, da clusterina/APOJ e de seu receptor, bem como análise da expressão proteica por Western blot. Os arquivos estão organizados em planilhas nos formatos .xlsx e .csv, contendo dados originais e reprodutíveis, gerados ao longo do período de doutorado no laboratório de origem. Este conjunto de dados fornece base para futuras investigações nas áreas de fisiologia ocular, envelhecimento, metabolismo e exercício físico.