Fundamento: O treinamento intervalado de alta intensidade (TIAI) tem sido utilizado como estratégia de exercício cardiovascular para promover maior adesão na reabilitação cardiovascular. No entanto, pouco se sabe sobre o efeito dessa modalidade de treinamento no controle autonômico cardíaco. Objetivo: Realizar uma revisão sistemática para avaliar os efeitos do TIAI nas respostas autonômicas cardíacas em humanos. Métodos: PEDro, SCOPUS e PubMed foram pesquisados desde o início até 29 de março de 2018. Além disso, a qualidade metodológica e os relatórios estatísticos de todos os ensaios clínicos elegíveis foram avaliados pela escala PEDro. Os artigos eram elegíveis se: O objetivo principal estivesse relacionado aos efeitos do TIAI no sistema nervoso autônomo cardíaco. Os desfechos avaliados foram medidas indiretas de controle autonômico cardíaco, representadas por índices de VFC. Resultados: As estratégias de busca resultaram em 339 citações e 2 citações adicionais foram identificadas por meio de outras fontes. Após excluir os artigos duplicados e revisar o texto completo, 6 artigos foram incluídos. De maneira geral, os resultados mostraram uma melhora na modulação parassimpática e / ou simpática após TIAI, quando avaliada por índices lineares e não lineares de VFC. Conclusões: O TIAI é uma ferramenta promissora para melhorar o controle autonômico cardíaco, com mais recomendação em indivíduos saudáveis e pacientes com síndrome metabólica.