Metabuscador de dados de pesquisa

DOI:	https://doi.org/10.48432/J9YG00
Título:	Dados de genotipagem da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa por 4.709 SNPs
Assunto:	Agricultural Sciences;Computer and Information Science
Descrição:	Esse conjunto de dados foi elaborado para permitir uma ampla amostragem do genoma do arroz por um número reduzido de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), e com isso viabilizar análises que requerem grande demanda computacional, como machine learning, por exemplo. O conjunto é composto por dados de genotipagem de 541 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa (CNAE) por 4.709 SNPs, tendo em média um SNP a cada 68.000 pares de base (pb), que é inferior ao desequilíbrio de ligação médio do arroz, em torno de 150.000 pb. Esse conjunto de dados foi elaborado a partir de um conjunto completo, composto por aproximadamente 400.000 SNPs. O diferencial desse conjunto de marcadores SNPs é que ele genotipou majoritariamente o germoplasma brasileiro de arroz, presente na CNAE, e que compõe a base genética do programa de melhoramento de arroz da Embrapa, que é marcadamente diferente da base genética do arroz asiático.
Autor(es):	Brondani, Claudio Vianello, Rosana Pereira Valdisser, Paula Arielle
URI:	https://doi.org/10.48432/J9YG00 https://www.redape.dados.embrapa.br/dataset.xhtml?amp;persistentId=doi:10.48432/J9YG00
Outros identificadores:
Fomento:	Embrapa
Número do Projeto:	03.09.01.018.00.01
Termo de uso:
Data:	16-Dez-2022
Data de Disponibilização:	23-Ago-2023
Formato:	application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
Tipo:	dados experimentais dados genéticos
Editora / Evento / Instituição:	Brondani, Claudio
Idioma :	English
Aparece nas coleções:	Redape – Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa

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